默認概要(Summary)方式顯示(見圖2.4),包含作者、文章標題、發表的期刊號及數據庫記錄號。摘要格式(Abstract)顯示內容:文獻題目、作者、第一作者單位(地址)、期刊來源(期刊名縮寫、出版日期、卷、頁數)、PMID號、出版類型,非英語文章...[繼續閱讀]
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默認概要(Summary)方式顯示(見圖2.4),包含作者、文章標題、發表的期刊號及數據庫記錄號。摘要格式(Abstract)顯示內容:文獻題目、作者、第一作者單位(地址)、期刊來源(期刊名縮寫、出版日期、卷、頁數)、PMID號、出版類型,非英語文章...[繼續閱讀]
GenBank數據庫是由美國國立生物技術信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)建立和維護的,它包含了所有已知的核酸序列和蛋白質序列,相關文獻著作及生物學詮釋。其數據來源于測序工作者直接提交和測序中心提交,以及與歐洲分子生物...[繼續閱讀]
EMBL由歐洲生物信息學研究所(EBI)維護,它與GeneBank和DDBJ數據共享。該數據庫由Oracle數據庫系統管理維護,可以通過因特網上的序列提取系統(SRS)查詢檢索,可用基于Web的WEBIN工具或Sequin軟件提交序列。EMBL網址:http://www.ebi.ac.uk/embl/SRS網址...[繼續閱讀]
該數據庫與GenBank和EMBL核酸庫合作交換數據。用戶使用其主頁上提供的SRS工具進行數據檢索和序列分析,或通過Sequin軟件提交序列。DDBJ網址:http://www.ddbj.nig.ac.jp/練習:(1)NCBI迄今已收集多少條水稻EST序列?(2)利用NCBIEntrez及SRS分別搜索ki...[繼續閱讀]
GDB為人類基因組計劃(HGP)保存和處理基因組圖譜數據,其目標是構建關于人類基因組的百科全書。GDB人類基因組區域包括基因、克隆、PCR擴增標記、斷點、細胞遺傳標記、易碎位點、EST序列、綜合區域、重疊克隆群及重復序列;人類基...[繼續閱讀]
EntrezGenome網址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=GenomeTIGRdatabases網址:http://www.tigr.org/tdb/GenBankFTPServerftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/genomes/...[繼續閱讀]
介紹氨基酸序列數據庫GenBank,SWISS-PROT使用方法。掌握如何查詢并獲取特定氨基酸的序列。相關網址:GenBankProteinhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=ProteinSWISS-PROTatExPASy(無冗余蛋白序列數據庫)http://us.expasy.org/sprot/自然界真實存在的蛋...[繼續閱讀]
介紹蛋白質結構數據庫PDB使用方法。掌握如何查詢并獲取特定蛋白的結構數據。相關網址:PDBhttp://www.pdb.org/用X衍射及核磁共振方法確認的蛋白質三維結構數據集。OWL(復合蛋白序列數據庫)http://www.bioinf.man.ac.uk/dbbrowser/OWL/PROSITE(Motif數...[繼續閱讀]